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【世界速看料】大流行预防研究的新工具：来自水和水蛭的DNA测序

2023-03-05 15:51:40 来源：互联网

(资料图片)

在由德国莱布尼茨动物园和野生动物研究所 (Leibniz-IZW) 领导的一项新科学研究中，评估了来自非洲和蒙古水坑的水以及来自东南亚水蛭的血粉的能力，以便在无需寻找哺乳动物病毒的情况下检索哺乳动物病毒。并捕捉哺乳动物。科学家们使用高通量测序分析了样本，以识别已知病毒以及科学上的新病毒。这两种方法都被证明是流行病预防研究的合适工具，因为它们可以发现和监测野生动物病毒的宿主。例如，鉴定出一种最有可能与东南亚鹿种相关的新型。结果发表在科学期刊《生态学与进化方法》上。

寻找和监测 SARS-CoV-2 等野生动物病毒的宿主(尚未发现该病毒的宿主)具有挑战性。许多野生动物栖息的地区很难进入，而且这些物种也很难找到或捕捉到。为了防止未来的大流行，如，迫切需要新的有效方法来发现和监测在野生动物中传播的病毒。当与高通量测序相结合时，基于环境 DNA (eDNA) 和无脊椎动物衍生 DNA (iDNA) 的方法可能会增强可用的工具包来克服这些挑战。科学家小组评估了来自非洲和蒙古水坑的水以及来自东南亚水蛭的血粉，以评估从两种样本类型中提取病毒的能力。此类样本的通常限制是它们仅包含少量的低质量 DNA，尤其是病原体 DNA。因此，作者使用现代“杂交捕获”方法找出与目前已知的脊椎动物病毒相似的序列，然后使用复杂的高通量技术对它们进行测序。这种方法是成功的，因为它允许在水和水蛭样本中识别已知和新型病毒。

来自水样的 DNA 产生了几种斑马和野驴常见的病毒，这是预料之中的，因为这些动物经常大量访问水坑。以在非洲水坑中发现的病毒为例，作者在相关出版物中证明这些病毒仍然具有传染性，这表明水本身可能是病毒传播的来源。从东南亚水蛭中，鉴定出许多已知和新型病毒。特别令人感兴趣的是一种以前科学上未知的新型，它可能代表科的一个全新属，似乎与鹿种有关。

“对于埃博拉等许多最致命的病毒，我们仍然不知道它们来自哪里，”野生动物疾病系主任亚历克斯格林伍德教授说。“当前的大流行表明我们对自然界中的病毒多样性仍然知之甚少。新方法可能会帮助我们识别新病毒及其潜在宿主，而不会遇到与直接收集野生动物样本相关的常见后勤和道德问题。”环境 DNA 在许多情况下被证明是有用的，包括难以进入地区的野生动物物种多样性的表征、古代种群的研究以及最近的病原体研究。来自水的环境 DNA 和来自吸血无脊椎动物的 DNA 可用于不同的环境。”

标签：野生动物哺乳动物无脊椎动物最有可能